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中药学论文_基于转录组学的中药药理机制分析方

来源:中药药理与临床 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2022年04月01日 09:58:46
【作 者】:网站采编
【关键词】:
【摘 要】:文章目录 1 资料与方法 1.1 数据获取及数据预处理 1.2 差异基因的识别 1.3 Cmap筛选药效作用相似的化合物 1.4 基因共表达网络构建 1.5 基因模块的识别 1.6 GO富集分析 1.7 蛋白互作网络(P

文章目录

1 资料与方法

1.1 数据获取及数据预处理

1.2 差异基因的识别

1.3 Cmap筛选药效作用相似的化合物

1.4 基因共表达网络构建

1.5 基因模块的识别

1.6 GO富集分析

1.7 蛋白互作网络(PPI)构建

1.8 HUB基因识别

1.9 DisGeNet数据库验证HUB基因

2 结果

2.1 质控分析

2.2 差异基因的识别

2.3 Cmap数据库分析相似化合物

2.4 基因共表达网络分析

2.5 GO富集分析

2.6 HUB基因的识别

2.7 DisGeNet数据库验证HUB基因

3 讨论

文章摘要:目的:结合高通量转录组测序技术提出一种中药药理机制分析方法,并以金花清感颗粒为例探究其发挥药效作用的关键机制。方法:对中药作用于细胞系进行高通量转录组测序,获得中药作用转录组表达谱;设计一种基于基因共表达网络的生物信息学分析技术,即依次进行差异表达基因的识别、药效作用相似化合物的筛选、基因共表达网络的构建、基因模块的识别、GO富集分析、蛋白互作网络的构建、 HUB基因的识别、 HUB基因的验证。利用以上方法分析金花清感颗粒的药理机制。结果和结论:通过该方法发现金花清感颗粒对于新冠肺炎(COVID-19)患者具有治疗作用,且对病毒感染后血小板脱颗粒、血液高凝状态引起的多器官氧化应激损伤具有潜在的治疗修复作用,为进一步阐明金花清感颗粒的作用提供了证据。该方法适用于大多数中药药理机制的分析,为中医药现代化研究提供了方法学支撑。

文章关键词:

项目基金:文章来源:《中药药理与临床》 网址: http://www.zyylylc.cn/qikandaodu/2022/0401/736.html

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